Lingkup penelitian Fakultas Pertanian dan Peternakan UMM adalah “PERTANIAN TERINTEGRASI BERBASIS ORGANIK”. Sejalan dengan itu, wilayah penelitian masing-masing prodi
1. Agroteknologi
“Pengembangan dan Penerapan Agroteknologi Berbasis Sistem Pertanian Organik Terpadu"
2. Agribisnis
“Pengembangan Pertanian Terpadu Berbasis Sumber Daya Manusia Kewirausahaan "
3. Teknologi Pangan
"Pengembangan Produk Pangan Organik dan Halal"
4. Kehutanan
"Pengembangan dan Penerapan Agroforestri Berbasis Model Ekosistem”
5. Peternakan
"Pengembangan dan Penerapan Sistem Peternakan Organik"
6. Akuakultur
"Sistem Budidaya Perairan Terpadu"
